מהר"ל: אקדמות – פרקי חיים, משנה, השפעה כולל מאמרים המשקפים את מצב המחקר של מהר"ל לסוגיותיו עד להופעתו. מאמריו הם אפוא 'אקדמות'. הם מציעים את כיווני המחקר הקיימים ומסמנים את העתידים להתפתח. הם משרטטים את דמותו של מהר"ל, שפעל במפנה המאות השש עשרה והשבע עשרה, בין אשכנז ה'היסטורית', מזה, למרכז האשכנזי החדש במזרח, בממלכת פולין, מזה, ובתווך, פראג הקיסרית, עירו של רודולף השני, אוהב החכמה, המדע והמָגיה, וחצרו הפתוחה לחדש, לישן, למפתיע ולמוזר. בתוך המרחבים הללו הולכת ומתבררת דמותו של מהר"ל כהוגה החשוב ביותר שפעל בחברה היהודית האירופית בעת החדשה וכמבקר החשוב ביותר של החברה היהודית ותרבותה בזמנו. מן המקום הזה ניסח את משנתו החינוכית החדשנית ויצר את הגותו השיטתית המקיפה, שהלכה ונחשפה בהדרגה רק למן המאה התשע עשרה, על סף התקופה המודרנית ממש, והשפיעה על הזרמים הדתיים המרכזיים שפעלו בחברה היהודית האירופית באותה עת – ועודנה משפיעה עד היום.
הספר מהר"ל: אקדמות מחולק לשישה שערים, הכוללים עשרים ואחד מאמרים, המשקפים כל אחד בדרכו כיוון מחקרי פעיל, ובהצטרפם – את מצב המחקר של מהר"ל ומשנתו כיום. הם דנים במרחב הרֵאלי שבתוכו פעלה הקהילה היהודית בפראג בימי מהר"ל, בפרקים מן הביוגרפיה הלא שלמה של מהר"ל, במשנתו ובזיקתה אל המדע החדש, בהשפעת מהר"ל והגותו על זרמי מחשבה יהודית בעת החדשה, ובייצוגים אמנותיים של דמות מהר"ל ושל הגולם, הדמות האגדית שהשפיעה יותר מכל על דימויו הציבורי, היהודי והלא יהודי כאחד.